转录是分子生物学中的一个关键过程,在RNA合成中有许多应用,包括mRNA疫苗和RNA疗法。然而,目前的RNA表征技术受到扩增和酶偏见的影响,导致天然信息的丢失。
剑桥大学Ulrich Felix Keyser和Filip Bošković等介绍了一种通过利用RNA纳米技术和纳米孔对RNA进行分级来定量研究转录和RNA聚合酶行为的策略。
本文要点:
(1)
首先,作者利用T7 RNA聚合酶转录缺少终止序列的线性DNA。令人惊讶的是,作者在复制序列的起点发现了选择性转录终止。接下来,作者使用没有转录终止子的环状DNA进行滚环转录。这使作者能够在单分子水平上深入了解RNA聚合酶的持续能力和转录行为。作者的工作展示了如何将RNA纳米技术和纳米孔串联起来用于RNA转录本的直接定量分析。
(2)
这种方法通过在单分子水平上研究全长RNA转录本,为精确的RNA结构作图提供了一条有前途的途径。
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Patiño-Guillén, G., Pešović, J., Panić, M. et al. Single-molecule RNA sizing enables quantitative analysis of alternative transcription termination. Nat Commun 15, 1699 (2024).
DOI: 10.1038/s41467-024-45968-8
https://doi.org/10.1038/s41467-024-45968-8