化学蛋白质组学技术揭示了小分子和蛋白质亲核试剂(主要是半胱氨酸)之间的共价相互作用。而大多数化学蛋白质组筛选方法都是间接的,其依赖于亲电片段和具有固有有限蛋白质组覆盖范围的最小亲电探针之间的竞争。在这里,加利福尼亚大学Jack Taunton开发了一个基于可点击芳基磺酰氟探针对映体对映体的化学蛋白质组学平台,其可用于直接亲电位点鉴定。
本文要点:
1) 通过使用立体选择性位点修饰作为完整细胞中可连接性的替代物,作者在功能多样的蛋白质位点中鉴定了634个酪氨酸和赖氨酸,这些蛋白质位点由结构多样的探针连接。在多个已验证的位点中,作者发现了一种手性探针,该探针修饰了表观遗传调节因子WDR5的MYC结合位点中的Y228。
2) 此外,该探针还得到了高分辨率晶体结构的证实。这种独特的手性探针是通过共价修饰的免疫肿瘤学靶点APMAP中的Y387来刺激肿瘤细胞的吞噬作用。该工作为共价化学探针的开发提供了可连接酪氨酸和赖氨酸的深层理解。
Chen Ying et.al Direct mapping of ligandable tyrosines and lysines in cells with chiral sulfonyl fluoride probes Nature Chemistry 2023
DOI: 10.1038/s41557-023-01281-3
https://doi.org/10.1038/s41557-023-01281-3